majunpeng，作者小马生信日记

ANNOVAR对VCF进行注释

2025年6月10日2025年5月7日作者 majunpeng

1. 前言通过Pggb做完了图泛的构建，接下来就要找到关键基因的SV，因此使用ANNOVAR来完成这项工作。 … 阅读更多

2025年5月6日作者 majunpeng

1. 前言最近看到了论文中都把多组的差异分析火山图分为多个图展示，虽然没什么问题，但是感觉追求顶刊这样的话有 … 阅读更多

2025年4月23日作者 majunpeng

1. 前言比较转录组是每个生信人入门的第一课，但是在如今卷科研绘图的年代，传统的图已经不能满足顶刊的需求了， … 阅读更多

2025年4月17日作者 majunpeng

Getorganelle 组装质体基因组 1. 前言 Getorganelle可以用来组装所有的质体基因组，但 … 阅读更多

2025年4月17日2025年4月17日作者 majunpeng

PGGB构建泛基因组 1. 前言老规矩，正式开始之前还是说一下为什么选择用PGGB构建图形泛基因组。其实在用 … 阅读更多

2025年7月28日2025年3月20日作者 majunpeng

1. 前言前面已经使用PGGB构建好了泛基因组，现在应该考虑如何进行可视化了，对比了几款可视化的软件，最后选 … 阅读更多

2025年3月20日2025年3月18日作者 majunpeng

使用Circos绘制图形泛基因组的圈图 1. 前言最近刚刚构完图形泛基因组，看了很多文章中都有图形泛基因组的 … 阅读更多

2025年3月22日2025年3月13日作者 majunpeng

1. Github官网下载安装包 2. R studio中本地下载包 devtools::install_lo … 阅读更多

2025年6月9日2025年3月10日作者 majunpeng

Hybpiper和Paragone-nf的使用 1. 前言 1.1 Hybpiper 官方介绍：HybPipe … 阅读更多

2026年1月22日2024年12月9日作者 majunpeng

WGDI: 全基因组加倍（WGD） 1.数据准备和预处理 WGDI要求（1）基因组文件；（2）基因组注释文件（ … 阅读更多