majunpeng，作者小马生信日记

转录组高级绘图-差异火山图进阶版

2025年4月23日作者 majunpeng

1. 前言比较转录组是每个生信人入门的第一课，但是在如今卷科研绘图的年代，传统的图已经不能满足顶刊的需求了， … 阅读更多

2025年4月17日作者 majunpeng

Getorganelle 组装质体基因组 1. 前言 Getorganelle可以用来组装所有的质体基因组，但 … 阅读更多

2025年4月17日2025年4月17日作者 majunpeng

PGGB构建泛基因组 1. 前言老规矩，正式开始之前还是说一下为什么选择用PGGB构建图形泛基因组。其实在用 … 阅读更多

2025年3月22日2025年3月20日作者 majunpeng

1. 前言前面已经使用Catus-pangenome构建好了泛基因组，现在应该考虑如何进行可视化了，对比了几 … 阅读更多

2025年3月20日2025年3月18日作者 majunpeng

使用Circos绘制图形泛基因组的圈图 1. 前言最近刚刚构完图形泛基因组，看了很多文章中都有图形泛基因组的 … 阅读更多

2025年3月22日2025年3月13日作者 majunpeng

1. Github官网下载安装包 2. R studio中本地下载包 devtools::install_lo … 阅读更多

2025年3月10日2025年3月10日作者 majunpeng

Hybpiper和Paragone-nf的使用 1. 前言 1.1 Hybpiper 官方介绍：HybPipe … 阅读更多

2024年12月9日2024年12月9日作者 majunpeng

WGDI: 全基因组加倍（WGD） 1.数据准备和预处理 WGDI要求（1）基因组文件；（2）基因组注释文件（ … 阅读更多

2024年12月28日2024年12月3日作者 majunpeng

CAFE 5：基因家族的扩张与收缩 1. 软件下载 ### 创建分析环境 mamba create -n Ge … 阅读更多

2024年11月25日2024年11月25日作者 majunpeng

基因功能注释 1. 软件和数据库下载 1.1 数据库下载 1.1.1 NR数据库 #通过Aspera高速下载 … 阅读更多