16S扩增子的样本和物种之间对应的Circos图
1. Circos在线绘图网站
2. 数据准备
Circos在线绘图网站要求上传的数据必须属纯文本的表格数据,可以是空格分隔也可以是制表符分隔,为了让表格的展示结果更直观,统计使用制表符分隔(Tab)。同时还可以通过上传的文件格式来指定分组和物种的颜色和顺序。
默认格式
| data | A | B | C | D |
|---|---|---|---|---|
| E | 105 | 450 | 92 | 96 |
| F | 20 | 46 | 78 | 33 |
| G | 118 | 553 | 94 | 317 |
| H | 100 | 18 | 108 | 104 |
指定分组的排列顺序
| data | 1 | 2 | 3 | 4 |
|---|---|---|---|---|
| data | A | B | C | D |
| E | 105 | 450 | 92 | 96 |
| F | 20 | 46 | 78 | 33 |
| G | 118 | 553 | 94 | 317 |
| H | 100 | 18 | 108 | 104 |
指定分组和物种的排列顺序
| data | data | 1 | 2 | 3 | 4 |
|---|---|---|---|---|---|
| data | data | A | B | C | D |
| 1 | E | 105 | 450 | 92 | 96 |
| 2 | F | 20 | 46 | 78 | 33 |
| 3 | G | 118 | 553 | 94 | 317 |
| 4 | H | 100 | 18 | 108 | 104 |
指定分组的色块颜色
| data | data | 255,136,0 | 186,255,0 | 104,152,178 | 38,82,153 |
|---|---|---|---|---|---|
| data | data | A | B | C | D |
| 255,136,0 | E | 10 | 10 | 10 | 10 |
| 186,255,0 | F | 20 | 20 | 20 | 20 |
| 200,200,200 | G | 30 | 30 | 40 | 40 |
| 150,150,150 | H | 50 | 50 | 60 | 60 |
3. 数据提交
选择文件→upload
注意:当指定分组和物种的顺序和颜色时,要分别勾选相应栏。
4. 结果下载
当运行完成后,会出现绘图结果的预览页面。
下载后,解压压缩包后,图在results文件夹下。
