小马的生信笔记

16S扩增子的样本和物种之间对应的Circos图

2. 数据准备

Circos在线绘图网站要求上传的数据必须属纯文本的表格数据,可以是空格分隔也可以是制表符分隔,为了让表格的展示结果更直观,统计使用制表符分隔(Tab)。同时还可以通过上传的文件格式来指定分组和物种的颜色和顺序。

默认格式

dataABCD
E1054509296
F20467833
G11855394317
H10018108104

指定分组的排列顺序

data1234
dataABCD
E1054509296
F20467833
G11855394317
H10018108104

指定分组和物种的排列顺序

datadata1234
datadataABCD
1E1054509296
2F20467833
3G11855394317
4H10018108104

指定分组的色块颜色

datadata255,136,0186,255,0104,152,17838,82,153
datadataABCD
255,136,0E10101010
186,255,0F20202020
200,200,200G30304040
150,150,150H50506060

3. 数据提交

选择文件→upload

注意:当指定分组和物种的顺序和颜色时,要分别勾选相应栏。

4. 结果下载

当运行完成后,会出现绘图结果的预览页面。

下载后,解压压缩包后,图在results文件夹下。

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